Seabagai lembaga pendidikan yang terstruktur tentu Pondok Pesantren Al-Falah Pakelsari memiliki Visi dan Misi dalam pelaksanaan program pembelajaran. Adapun Visi, Misi, Tujuan, dan Motto sebagai berikut :
- Visi
Menjadi pesantren yang terdepan dalam mengamban dan menjaga moralitas umat dan keseimbangan aqidah, syariat, dan akhlaq mulia menuju manusia paripurna.
- Misi
1. Menyelenggarakan pendidikan keagamaan yang berbasis kitab kuning.
2. Mengajarkan akhlaq mulia melalui keteladanan yang baik.
3. Mengajarkan pembiasaan saat berpikir dan bersikap tawasuth (moderat), tawazun(seimbang, tasamuh (toleransi), dan I’tidal (konsisten).
4. Mengajarkan gotong royong melalui kerja bakti lingkungan setiapo hari.
- Motto
"BERILMU AMALIAH, BERAMAL ILMIAH, BERKARAKTER USWAH"